Capture d’écran de l’explorateur d’arbre de vie OneZoom avec des feuilles colorées en fonction du risque d’extinction et montrant la vue en « spirale » de l’arbre. Crédit : OneZoom
OneZoom est un site unique pour explorer toute la vie sur Terre, son histoire évolutive, et combien d’entre elles sont menacées d’extinction.
L’explorateur OneZoom – disponible sur onezoom.org – cartographie les connexions entre 2,2 millions d’espèces vivantes, ce qui se rapproche le plus d’une vue unique de toutes les espèces connues de la science. L’arbre de vie interactif permet aux utilisateurs de zoomer sur n’importe quelle espèce et d’explorer ses relations avec les autres, dans une visualisation transparente sur une seule page Web. L’explorateur comprend également des images de plus de 85 000 espèces, ainsi que, lorsqu’elles sont connues, leur vulnérabilité à l’extinction.
OneZoom a été développé par collège impérial de Londres chercheur en biodiversité Dr James Rosindell et Université d’Oxford biologiste évolutionniste Dr Yan Wong. Dans un article publié aujourd’hui dans Méthodes en écologie et évolution, les Drs Wong et Rosindell présentent le résultat de plus de dix ans de travail, créant progressivement ce qu’ils considèrent comme « la Google Earth de la biologie ».
Le Dr Wong, du Big Data Institute de l’Université d’Oxford, a déclaré : « En développant de nouveaux algorithmes pour la visualisation et le traitement des données, et en les combinant avec des « grandes données » recueillies à partir de plusieurs sources, nous avons créé quelque chose de magnifique. Cela permet aux gens de trouver leurs êtres vivants préférés, qu’il s’agisse de taupes dorées ou de séquoias géants, et de voir comment l’histoire de l’évolution les relie pour créer un arbre géant de toute vie sur Terre.
Le Dr Rosindell, du Département des sciences de la vie de l’Impériale, a déclaré : « Nous avons travaillé dur pour rendre l’arbre facile à explorer pour tout le monde, et nous espérons également envoyer un message puissant : qu’une grande partie de notre biodiversité est menacée.
Les « feuilles » représentant chaque espèce de l’arbre sont codées par couleur en fonction de leur risque d’extinction : verte pour non menacée, rouge pour menacée et noire pour récemment éteinte. Cependant, la plupart des feuilles de l’arbre sont grises, ce qui signifie qu’elles n’ont pas été évaluées ou que les scientifiques ne disposent pas de suffisamment de données pour connaître leur risque d’extinction. Même parmi les espèces décrites par la science, seule une infime fraction a été étudiée ou présente un risque connu d’extinction.
Le Dr Wong a ajouté : « C’est extraordinaire la quantité de recherche qu’il reste encore à faire. Construire l’arbre de vie OneZoom n’était possible que grâce à des méthodes sophistiquées pour rassembler et combiner les données existantes – il aurait été impossible de tout gérer à la main. »
L’explorateur OneZoom est configuré pour fonctionner avec des écrans tactiles, et les développeurs ont rendu le logiciel gratuit à télécharger et à utiliser par les organisations éducatives telles que les musées et les zoos.
Le Dr Rosindell a commenté : « Deux millions d’espèces peuvent sembler être un nombre trop grand pour être visualisé, et aucun musée ou zoo ne peut toutes les contenir ! Mais notre outil peut aider à représenter toutes les espèces de la Terre et permettre aux visiteurs de se connecter avec leur sort. Nous espérons que maintenant ce projet est terminé et disponible, de nombreux sites seront intéressés à l’utiliser pour compléter leurs affichages existants.
Les Drs Rosindell et Wong ont également créé une association caritative OneZoom dans le but d’utiliser leur arbre de vie pour “faire progresser l’éducation du public sur les sujets de l’évolution, de la biodiversité et de la conservation de la variété de la vie sur Terre”.
Uniquement, pour soutenir cette œuvre caritative, chaque feuille de l’arbre est disponible pour le parrainage, permettant à quiconque d'”adopter” une espèce et permettant à OneZoom de poursuivre sa mission. Plus de 800 feuilles ont actuellement été parrainées par des individus et des organisations sélectionnées, beaucoup avec des messages personnels sur la façon dont ils se sentent liés à la conservation de la nature.
L’équipe a également intégré l’arbre aux données du projet Wikipédia pour révéler la « popularité » de chaque espèce, en fonction de la fréquence à laquelle leur page Wikipédia est consultée. Le Dr Wong a déclaré : « Sans surprise, les humains arrivent en tête, mais il a changé de place à quelques reprises avec le deuxième plus populaire : le loup gris – l’« espèce » qui comprend tous les chiens domestiques. »
Dans le monde végétal, le cannabis arrive en tête, suivi du chou, de la pomme de terre et de la noix de coco. Les poissons à nageoires rayonnées les plus populaires sont les espèces de pêche sportive, en particulier le saumon et la truite.
Maintenant que l’arbre est terminé, l’équipe espère créer des « visites » et des expériences sur mesure d’espèces connectées de nouvelles manières imaginatives – telles que des visites d’animaux irisés, de plantes médicinales ou même d’espèces nommées d’après des célébrités. Ils ont créé un outil spécial de capture d’écran pour une sauvegarde et un partage faciles des visites générées par les utilisateurs.
Le Dr Rosindell a déclaré : “Avec OneZoom, nous espérons offrir aux gens une toute nouvelle façon d’apprécier l’histoire de l’évolution et l’immensité de la vie sur Terre dans toute sa beauté.”
Référence : « Visualisation dynamique d’arbres à millions de pointes : le projet OneZoom » par Yan Wong et James Rosindell, Methods in Ecology and Evolution.
DOI : 10.1111/2041-210X.13766
