Quelle est la probabilité qu’Omicron mute en quelque chose de plus mortel ?

Il est difficile de savoir ce que signifie Omicron pour l’avenir de la pandémie. Alors que certains ont suggéré avec optimisme qu’il pourrait s’agir de la dernière poussée avant que les États-Unis n’entrent dans une période d’endémicité plus encourageante, les scientifiques ont également averti que la variante omicron – qui est moins grave mais plus transmissible que la delta – pourrait se transformer en quelque chose de plus mortel.

“Les gens se sont demandés si le virus allait évoluer vers la douceur, mais il n’y a aucune raison particulière pour qu’il le fasse”, a déclaré la semaine dernière à l’Associated Press le Dr Stuart Campbell Ray, expert en maladies infectieuses à l’Université Johns Hopkins. “Je ne pense pas que nous puissions être sûrs que le virus deviendra moins mortel avec le temps”.

Comme Salon l’a précédemment rapporté, les virus à ARN comme le SRAS-CoV-2 sont, bien sûr, toujours en mutation ; chaque réplication dans les cellules d’un hôte crée un moment pour qu’une mutation fortuite émerge. Bien que les virus ne soient techniquement pas vivants, il est dans leur nature de muter et d’évoluer lorsqu’ils infectent les cellules de leurs hôtes et se répliquent ; c’est ainsi qu’ils survivent.

En général, le processus d’évolution favorise ceux qui se reproduisent plus vite et mieux que leurs frères et sœurs. Pour les virus, cela se produit lorsqu’ils deviennent plus transmissibles – c’est ce que nous avons vu avec delta, puis omicron. Mais qui peut dire que le virus ne va pas muter en quelque chose de plus transmissible, puis de plus mortel plus tard au cours de la période d’infection ?

“Nous avons deux problèmes – le premier est de savoir si l’omicron peut prendre ce qu’il a et mieux se fixer aux récepteurs dans les poumons avec une seule mutation”, a déclaré le Dr George Rutherford, professeur et chef de la division des maladies infectieuses et de l’épidémiologie mondiale à l’Université de Californie, San Francisco. “Ils sont à deux ou trois mutations près, et s’il le faisait mieux, alors il causerait une maladie plus grave et serait potentiellement plus mortel – mais l’évolution de cet organisme prend de véritables tournants.”

En effet, s’il est scientifiquement possible que l’omicron mute en une version plus mortelle de sa forme transmissible, il y a des raisons de penser que cela ne se produira pas nécessairement.

“Le delta et l’omicron n’étaient pas une sorte d’extension logique de ce qu’ils étaient auparavant. Ce n’étaient pas des mutations de deux acides aminés par rapport aux variantes antérieures ; elles étaient très différentes des variantes antérieures, ce qui conduit à deux scénarios possibles”, a déclaré Rutherford à Salon. “Le premier scénario est que quelqu’un qui a été infecté était immunodéprimé, et qu’il a fallu environ 200 jours pour éliminer le virus. Donc, chez une seule personne, il est passé par plusieurs mutations.”

L’autre scénario, explique Rutherford, est que l’omicron avait une “piste d’évolution parallèle” – de l’infection d’animaux à celle d’un humain, puis de nouveau à celle d’humains – qui pourrait avoir causé toutes ses mutations.

“Il y a une théorie qui circule, avec les deux théories qui circulent, que cela provenait d’un patient infecté par le VIH en Afrique australe”, a déclaré Rutherford. “Ou bien il y a des données convaincantes qui vous amèneraient à penser que cela pourrait avoir évolué chez les souris, puis être passé de la souris à une population humaine.”

En effet, les scientifiques savent que des animaux comme les visons peuvent développer le COVID-19. En 2020, le Danemark a abattu des millions de visons en réponse à des épidémies de COVID-19 dans plus de 200 élevages de visons.

“Pour ce qui est de prédire ce qui va se passer avec la variante omicron, elle pourrait être remplacée par quelque chose de très différent”, a déclaré Rutherford, ajoutant qu’il y a trois possibilités qu’il voit se produire avec l’omicron, étant donné qu’il est déjà tellement transmissible qu’une transmissibilité accrue pourrait ne pas favoriser la variante d’un point de vue évolutif. “Il faut envisager quelque chose qui présente un avantage sélectif pour le virus”.

Selon Rutherford, la première des trois possibilités est que l’omicron devienne plus transmissible et “accoste le récepteur”. Une deuxième possibilité est que le virus puisse excréter chez les individus pendant une période plus longue – au lieu de deux ou trois jours, cela pourrait être sept ou huit – et infecter plus de personnes de cette façon. La troisième possibilité est qu’il puisse développer des propriétés pour devenir plus immuno-évasif et contourner complètement l’immunité construite par les vaccins.

“Alors, que nous réserve la prochaine mutation ? Qui sait, mais ce sont les types de caractéristiques qui conduiraient un virus à produire une progéniture par infection et lui donneraient un avantage sélectif”, a déclaré Rutherford. “Tuer l’hôte ne lui donne pas nécessairement un avantage sélectif – mais il ne faut pas trop y penser, car si cela rend le virus plus transmissible, le virus ne s’en soucie pas vraiment.”

Le Dr Monica Gandhi, médecin spécialiste des maladies infectieuses et professeur de médecine à l’Université de Californie, à San Francisco, a déclaré à Salon que l’omicron.La transmissibilité pourrait l’empêcher de muter en quelque chose de pire parce que de nombreuses personnes ont été, et sont susceptibles d’être, exposées à l’omicron. Cela signifie que plus d’individus dans la population développent une immunité.

Si l’omicron mutait pour devenir plus mortel, vous seriez toujours immunisé contre tous ses autres épitopes”. [little pieces of the virus]”, a déclaré Gandhi. “Avec l’omicron et les vaccinations, il y aura de moins en moins de personnes dans ce pays sans aucune immunité. Donc, si l’omicron mutait pour devenir plus mortel, vous seriez toujours immunisé contre tous ses autres antigènes. Il faudrait que ce soit un tout nouveau virus pour que vous ne puissiez pas le combattre.”

Gandhi ajoute qu’il n’y a “aucun doute” que l’omicron a également augmenté l’immunité mondiale, plus que la variante delta.

“Et parce qu’elle est plus bénigne, c’est un gros problème dans la mesure où certaines personnes ne savent pas qu’elles l’ont”, a déclaré Gandhi. “Et c’est ainsi que le [flu] pandémie a pris fin. Ce n’est pas qu’elle a disparu – elle est devenue endémique et est devenue quelque chose que nous avons simplement traité.”

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