Le microbiote nasal contient des indices sur les personnes qui développeront les symptômes du COVID à partir du nouveau coronavirus.
Le microbiote du nez et du haut de la gorge contient probablement des biomarqueurs pour évaluer la maladie d’un individu infecté par SRAS-CoV-2 peuvent obtenir et pour développer de nouvelles stratégies de traitement pour améliorer leurs résultats, selon les chercheurs.
Ce microbiote nasopharyngé est généralement considéré comme une protection de première ligne contre les virus, bactéries et autres agents pathogènes qui pénètrent dans ces voies de passage naturelles, explique le Dr Sadanand Fulzele, chercheur en gériatrie au Département de médecine du Medical College of Georgia de l’Université d’Augusta.
Des schémas distincts sont apparus lorsque les chercheurs ont examiné le microbiote de 27 personnes âgées de 49 à 78 ans qui étaient négatives pour le virus, 30 qui étaient positives mais n’avaient aucun symptôme et 27 qui étaient positives avec des symptômes modérés qui n’ont pas nécessité d’hospitalisation, rapportent-elles dans le journal Diagnostique.
« Des millions de personnes sont infectées et relativement peu d’entre elles deviennent symptomatiques. Cela pourrait être l’une des raisons », explique le Dr Ravindra Kolhe, directeur du Georgia Esoteric and Molecular Laboratory de MCG, ou GEM Lab. qui a effectué plus de 100 000 tests COVID.
Dr. Sadanand Fulzele (à gauche) et le Dr. Ravindra Kolhé. Crédit : Michael Holahan, Université Augusta
Les changements les plus importants se sont produits chez ceux qui étaient symptomatiques, dont environ la moitié des patients n’ayant pas une quantité suffisante de microbiote pour même séquencer, explique l’auteur correspondant Fulzele.
Ils ont été surpris de trouver ces « lectures faibles » de bactéries dans la cavité nasopharyngée d’individus symptomatiques contre seulement deux et quatre individus dans les groupes négatifs et positifs sans symptômes, respectivement. La grande majorité des individus positifs sans symptômes avaient encore un microbiote suffisant, note le premier auteur Kolhe.
« Nous ne savons pas ce qui est arrivé en premier, la maladie ou l’effacement du microbiote », explique Fulzele. Le nez qui coule et les éternuements pourraient expliquer la perte, un nombre déjà nettement inférieur d’habitants bactériens pourrait avoir augmenté le risque des individus de développer ce genre de symptômes, ou le virus peut avoir changé le paysage, explique Fulzele, qui soupçonne que c’est ce dernier.
Sur la base de l’expérience du microbiote dans le tractus gastro-intestinal, Kolhe pense que le contenu et la taille différents du microbiote sont un autre bon pari et ils aimeraient tous les deux une réponse définitive. « Nous n’avons pas suffisamment de données pour le moment », déclare Kolhe.
Ils ont également trouvé des différences dans le type de bactéries, bien que les chercheurs notent que la fonction de certaines des bactéries qu’ils ont trouvées ne sont pas bien comprises.
Comme le nom du virus et près de deux ans d’expérience avec celui-ci l’indiquent, une méthode majeure de transmission du coronavirus 2 du syndrome respiratoire aigu sévère, ou SRAS-Cov-2, est lorsqu’une personne tousse, éternue ou même parle, et des gouttelettes appelées aérosols portant le le virus se déplace dans l’air et dans le nez ou la bouche d’une autre personne.
Les personnes âgées de 65 ans et plus et/ou souffrant de problèmes de santé sous-jacents comme l’hypertension et le diabète sont considérées comme présentant un risque accru d’hospitalisation et de décès dus à l’infection. individus plus âgés.
La doublure humide et productrice de mucus de cette zone fonctionne comme une barrière naturelle contre les envahisseurs et il existe également un complément important de cellules immunitaires présentes, dit Fulzele, et leur réponse aux virus respiratoires est essentielle.
La zone regorge également de récepteurs ACE-2, auxquels le virus épineux se lie, et Kolhe dit que c’est un point d’atterrissage majeur pour ce virus.
Leurs nouvelles découvertes indiquent que le microbiote altéré chez les patients symptomatiques a eu un impact sur leur réponse immunitaire au virus, selon Kolhe et Fulzele.
Les individus symptomatiques présentaient des taux significativement plus élevés de deux espèces bactériennes, dont Cutibacterium, généralement retrouvées sur la peau et associées à l’acné mais aussi aux infections cardiaques et aux infections de l’épaule suite à une intervention chirurgicale. À l’inverse, il y avait une présence significativement plus faible d’une poignée d’autres bactéries peu étudiées.
Le microbiote des deux groupes infectés, symptomatique et asymptomatique, présentait des niveaux élevés de bactéries comme les cyanobactéries, également appelées algues bleu-vert, que l’on peut trouver dans l’eau contaminée mais qui est un habitant habituel du microbiome chez l’homme qui semble avoir un rôle de régulation. la réponse immunitaire. Ces bactéries pénètrent généralement dans le corps par les surfaces muqueuses, comme celles du nez, et sont connues pour provoquer une pneumonie et des lésions hépatiques. Ceux qui étaient symptomatiques avaient deux fois plus de cette bactérie que leurs homologues asymptomatiques.
Fulzele note qu’entre les asymptomatiques et symptomatiques, il n’y a eu aucun changement significatif dans la diversité du microbiote – juste ces grandes différences de volume – mais ils ont vu beaucoup de bactéries individuelles monter et descendre en nombre.
Par exemple, leur graphique du nombre d’une autre bactérie aimant l’eau, Amylibacter, ressemblait à des marches d’escalier lorsqu’il passait du négatif au positif avec des symptômes, alors qu’il y avait une tendance à la baisse pour une poignée d’autres bactéries.
Alors que la relation entre le microbiote nasopharyngé et la sévérité de COVID-19[feminine reste inconnue, leur étude indique une “forte association” entre le microbiote nasal, l’infection par le SRAS-CoV-2 et la gravité, écrivent-ils.
Leur analyse a été effectuée avant que les variantes virales actuelles ne commencent à faire surface, mais les chercheurs disent que les différences dans le microbiote seront probablement également valables pour celles-ci et ils ont déjà commencé cette analyse.
Des études plus importantes sont nécessaires pour s’assurer que les modèles clairs qu’ils ont trouvés se maintiennent, selon les chercheurs. Ils préparent une demande de subvention qui permettra une étude plus large et recherchent d’autres sites de test qui souhaitent être partenaires. L’utilisation du même écouvillon nasopharyngé utilisé pour de nombreux tests COVID permettrait d’effectuer une analyse du microbiote en même temps que les tests, disent-ils.
Ils notent le contraste frappant qui est apparu au cours de près de deux ans d’expérience avec le virus, la majorité des personnes infectées étant asymptomatiques ou présentant des symptômes légers comme elles le feraient avec un rhume, tandis que d’autres contractent une pneumonie virale grave, nécessitent une hospitalisation et meurent.
Une poignée d’études récentes ont maintenant été publiées suggérant que la composition bactérienne du canal nasal peut avoir une influence “drastique” sur le développement des infections respiratoires et la gravité des symptômes, écrivent-ils. Certaines études ont indiqué que le microbiote nasal peut influencer la charge virale, la réponse immunitaire et les symptômes d’une infection à rhinovirus, qui est responsable de 10 à 40 % des rhumes.
Une myriade d’autres conditions comme le syndrome inflammatoire de l’intestin, les ulcères peptiques et les maladies virales ont été liées à des changements importants dans le microbiote de l’intestin, de la cavité nasale et buccale, écrivent-ils.
La diversité des bactéries dans le microbiote est généralement une bonne chose, et c’est quelque chose qui diminue naturellement avec l’âge, dit Fulzele, et peut également être altérée par des habitudes comme le tabagisme et améliorée par ceux comme une alimentation diversifiée.
Référence : « Altération du profil du microbiote nasopharyngé chez les patients âgés atteints de COVID-19 » par Ravindra Kolhe, Nikhil Shri Sahajpal, Sagar Vyavahare, Akhilesh S. Dhanani, Satish Adusumilli, Sudha Ananth, Ashis K. Mondal, G. Taylor Patterson, Sandeep Kumar , Amyn M. Rojiani, Carlos M. Isales et Sadanand Fulzele, 5 septembre 2021, Diagnostique.
DOI : 10.3390/diagnostics11091622
Le travail a été soutenu en partie par les National Institutes of Health.
