Une équipe internationale de scientifiques a créé une nouvelle ressource puissante pour accélérer le développement de vaccins et de traitements pour lutter contre la prochaine pandémie.
Le chercheur Wladek Minor, PhD, de la faculté de médecine de l’Université de Virginie, et des collaborateurs en Chine et en Pologne ont développé un système d’information sur Internet, appelé virusMED, qui décrit tout ce que nous savons sur la structure atomique et les vulnérabilités potentielles de plus de 800 souches de virus provenant de 75 différentes familles de virus, y compris SRAS-CoV-2, grippe, Ebola et VIH-1. Plusieurs des collaborateurs, dont l’enquêteur principal, Heping Zheng, sont d’anciens étudiants et membres du laboratoire de Minor à l’UVA.
Ce nouveau panorama des protéines des menaces potentielles aidera les scientifiques à réagir rapidement et efficacement contre le prochain agent pathogène prêt à faire des ravages sur l’humanité. Minor et ses collaborateurs comparent la ressource à Google Maps, en ce sens qu’elle organise et annote les principaux points d’intérêt sur un virus que les scientifiques peuvent utiliser comme feuille de route pour le développement de médicaments et de vaccins.
Une image produite par virusMED, un outil que les scientifiques peuvent utiliser pour développer de nouveaux traitements et vaccins pour la prochaine pandémie. Crédit : Avec l’aimable autorisation de Wladek Minor
« La bataille avec COVID-19[feminine n’est pas encore terminé, mais nous avons hâte de commencer à préparer la prochaine pandémie. VirusMED est une étape vers un système d’information avancé qui rassemble des chercheurs possédant une expertise diversifiée pour relever des défis biomédicaux complexes », a déclaré Minor, professeur distingué Harrison de physiologie moléculaire et de physique biologique à l’UVA. « Les informations contenues dans virusMED aideront les chercheurs viraux de nombreuses disciplines, en particulier ceux qui travaillent sur la conception de médicaments ou les thérapies antivirales. Nous fournissons une nouvelle analyse structurelle et intégrons des informations pertinentes provenant de diverses ressources pour fournir une image complète des régions les plus importantes et les plus vulnérables des protéines.
Points d’accès aux virus
En déverrouillant rapidement le mécanisme d’action du virus SARS-CoV-2, les scientifiques ont pu développer des vaccins sûrs et efficaces contre le COVID-19. La nouvelle base de données de Minor vise à mettre ce type d’informations critiques à portée de main des scientifiques en un seul endroit pratique.
VirusMED contient des informations détaillées sur les espèces et les souches de virus, les hôtes, les protéines virales et les anticorps, ainsi que les médicaments qui ont déjà été approuvés par la Food and Drug Administration des États-Unis, entre autres données scientifiques importantes. Les chercheurs appellent les points d’intérêt d’un virus ses « points chauds », et ces points chauds constituent des points de départ solides pour le développement de médicaments et de vaccins.
Le chercheur Wladek Minor, PhD, de la faculté de médecine de l’Université de Virginie, et des collaborateurs en Chine et en Pologne ont développé un système d’information sur Internet, appelé virusMED, qui décrit tout ce que nous savons sur la structure atomique et les vulnérabilités potentielles de plus de 800 souches de virus provenant de 75 différentes familles de virus, y compris le SRAS-CoV-2, la grippe, Ebola et le VIH 1. Crédit : Dan Addison | Communication UVA
“L’une des thérapies par anticorps indifférentes aux souches les plus prometteuses développées pour le traitement du COVID-19 a utilisé ce type d’informations pour améliorer un anticorps unique isolé d’un survivant infecté par le virus du SRAS en 2003”, a déclaré David Cooper, PhD, enseignant chercheur au laboratoire de Minor. « Les gens qui sont surpris par la conception rapide de médicaments et de vaccins ne réalisent pas que les chercheurs d’aujourd’hui s’appuient sur des décennies de recherches antérieures. »
L’un des principaux avantages de virusMED est qu’il rassemble les connaissances existantes sur les virus en un seul endroit, a déclaré Minor. Auparavant, ces données étaient réparties sur plusieurs ressources et souvent « en silo », de sorte qu’elles n’étaient pas facilement accessibles. Avec virusMED, les chercheurs peuvent parcourir les informations par virus ou par leur point d’intérêt.
La base de données gratuite et accessible à tous est disponible sur https://virusmed.biocloud.top.
« L’un des objectifs de mon laboratoire est de créer des outils que d’autres scientifiques peuvent utiliser. Nous regardons la forêt et trouvons des moyens d’aider les autres à se concentrer sur les arbres », a déclaré Minor. « La génération de ressources n’est pas glamour, mais le but ultime de la science est d’améliorer la vie. L’un des pairs évaluateurs anonymes de l’article a affirmé qu’ils étaient instantanément devenus un utilisateur enthousiaste du système. Nous nous attendons à ce que virusMED fasse vraiment la différence. »
Référence : « virusMED : an atlas of hotspots of viral protein » par HuiHui Zhang, Pei Chen, Haojie Ma, Magdalena Woinska, Dejian Liu, David R. Cooper, Guo Peng, Yousong Peng, Lei Deng, Wladek Minorc et Heping Zheng, 28 septembre 2021, Revue IUCr.
DOI : 10.1107/S2052252521009076
Les chercheurs ont publié leurs découvertes dans la revue scientifique Revue IUCr. Le travail sera présenté sur la couverture de la revue. L’équipe de recherche était composée de HuiHui Zhang, Pei Chen, Haojie Ma, Magdalena Woinska, Dejian Liu, Cooper, Guo Peng, Yousong Peng, Lei Deng, Minor et Zheng.
Le travail a été soutenu par la Fondation des sciences naturelles de la province du Hunan et la Fondation nationale des sciences naturelles de Chine. Minor et Cooper ont été soutenus par l’Institut national des sciences médicales générales des National Institutes of Health, subvention R01-GM132595.
