La super-bactérie SARM est apparue chez les hérissons bien avant l’utilisation des antibiotiques.

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La super-bactérie SARM est apparue chez les hérissons bien avant l'utilisation des antibiotiques.
Hérisson

Selon les chercheurs, ces résultats ne sont pas une raison de craindre les hérissons. Crédit : Pia B. Hansen

Les scientifiques ont trouvé des preuves qu’un type de superbactérie résistante aux antibiotiques, le SARM, est apparu dans la nature bien avant l’utilisation d’antibiotiques chez l’homme et le bétail, qui a traditionnellement été tenue responsable de son émergence.

  • Les hérissons sont porteurs d’un champignon et d’une bactérie sur leur peau, et les deux sont engagés dans une bataille pour la survie.
  • Le champignon sécrète des antibiotiques pour tuer la bactérie, mais en réponse, la bactérie a développé une résistance aux antibiotiques, devenant ainsi résistante à la méthicilline. Staphylococcus aureus, ou SARM
  • Jusqu’à 60% des hérissons sont porteurs d’un type de SARM appelé mecC-MRSA, qui est à l’origine de 1 sur 200 de toutes les infections MRSA chez l’homme.
  • Des processus biologiques naturels, et non l’utilisation d’antibiotiques, ont conduit à l’émergence initiale de cette superbactérie chez les hérissons il y a environ 200 ans.

Staphylococcus aureus a développé pour la première fois une résistance à l’antibiotique méthicilline il y a environ 200 ans, selon une vaste collaboration internationale comprenant l’université de Cambridge, le Wellcome Sanger Institute, le Serum Statens Institut du Danemark et les Royal Botanic Gardens, Kew, qui a retracé l’histoire génétique de la bactérie.

Ils ont enquêté sur la découverte surprenante – à partir d’enquêtes sur les hérissons au Danemark et en Suède – que jusqu’à 60 % des hérissons sont porteurs d’un type de SARM appelé “MRSA”. mecC-MRSA. La nouvelle étude a également révélé des taux élevés de SARM dans des écouvillons prélevés sur des hérissons dans toute leur aire de répartition en Europe et en Nouvelle-Zélande.

L’étude a été publiée le 5 janvier 2022 dans le journal Nature.

Les chercheurs pensent que la résistance aux antibiotiques a évolué en Staphylococcus aureus comme une adaptation à la coexistence du champignon sur la peau des hérissons. Trichophyton erinaceiqui produit ses propres antibiotiques.

La résistance à la méthicilline qui en résulte Staphylococcus aureus est plus connu sous le nom de SARM. La découverte de cette résistance séculaire aux antibiotiques est antérieure à l’utilisation des antibiotiques en milieu médical et agricole.

Champignons et bactéries

La photo montre le champignon Trichophyton erinacei se développant au centre d’une gélose ensemencée de SARM dans la moitié gauche et de bactéries Staphylococcus aureus sensibles à la méthicilline dans la moitié droite. Le champignon produit des antibiotiques qui tuent les bactéries Staphylococcus aureus sensibles à la méthicilline mais pas le SARM, ce qui donne une zone claire sur la droite, sans croissance bactérienne. Crédit : Claire L. Raisen

“En utilisant la technologie de séquençage, nous avons tracé les gènes qui donnent mecC-MRSA sa résistance aux antibiotiques jusqu’à leur première apparition, et nous avons découvert qu’ils existaient déjà au XIXe siècle”, a déclaré le Dr Ewan Harrison, chercheur au Wellcome Sanger Institute et à l’Université de Cambridge et auteur principal de l’étude.

Il ajoute : “Notre étude suggère que ce n’est pas l’utilisation de la pénicilline qui a conduit à l’émergence initiale du SARM, mais un processus biologique naturel. Nous pensons que le SARM a évolué dans une bataille pour la survie sur la peau des hérissons, et s’est ensuite propagé au bétail et aux humains par contact direct.”

On pensait auparavant que la résistance aux antibiotiques chez les microbes responsables d’infections humaines était un phénomène moderne, dû à l’utilisation clinique des antibiotiques. Le mauvais usage des antibiotiques accélère désormais le processus, et la résistance aux antibiotiques atteint des niveaux dangereusement élevés dans toutes les régions du monde.

Étant donné que presque tous les antibiotiques que nous utilisons aujourd’hui sont apparus dans la nature, les chercheurs affirment qu’il est probable que la résistance à ces produits existe déjà dans la nature également. La surutilisation d’un antibiotique chez l’homme ou le bétail favorise les souches résistantes de l’insecte, ce n’est donc qu’une question de temps avant que l’antibiotique ne commence à perdre son efficacité.

“Cette étude est un avertissement brutal : lorsque nous utilisons des antibiotiques, nous devons les utiliser avec précaution. Il existe un très grand ‘réservoir’ sauvage où les bactéries résistantes aux antibiotiques peuvent survivre – et de là, il n’y a qu’un pas à franchir pour qu’elles soient absorbées par le bétail, puis infectent les humains”, a déclaré le professeur Mark Holmes, chercheur au département de médecine vétérinaire de l’université de Cambridge et auteur principal du rapport.

En 2011, des travaux antérieurs menés par le professeur Holmes ont permis d’identifier pour la première fois les éléments suivants mecC -MRSA dans des populations humaines et de vaches laitières. À l’époque, il a été supposé que la souche était apparue dans la région de l’Atlantique.les vaches en raison de la grande quantité d’antibiotiques qu’elles reçoivent systématiquement.

Le SARM a été identifié pour la première fois chez des patients en 1960, et environ 1 sur 200 de toutes les infections au SARM sont causées par des bactéries. mecC-SARM. En raison de sa résistance aux antibiotiques, le SARM est beaucoup plus difficile à traiter que les autres infections bactériennes. L’Organisation mondiale de la santé considère désormais le SARM comme l’une des plus grandes menaces mondiales pour la santé humaine. Il constitue également un défi majeur pour l’élevage.

Selon les chercheurs, ces résultats ne sont pas une raison de craindre les hérissons : les humains sont rarement infectés par le SARM. mecC-MRSA, même s’il est présent chez les hérissons depuis plus de 200 ans.

“Les hérissons ne sont pas les seuls à abriter des bactéries résistantes aux antibiotiques – tous les animaux sauvages sont porteurs de nombreux types de bactéries, ainsi que de parasites, de champignons et de virus”, a déclaré Holmes.

Il ajoute : “Les animaux sauvages, le bétail et les humains sont tous interconnectés : nous partageons tous le même écosystème. Il n’est pas possible de comprendre l’évolution de la résistance aux antibiotiques si l’on ne considère pas l’ensemble du système.”

Référence : “Emergence of methicillin resistance predates the clinical use of antibiotics” par Jesper Larsen, Claire L. Raisen, Xiaoliang Ba, Nicholas J. Sadgrove, Guillermo F. Padilla-González, Monique S. J. Simmonds, Igor Loncaric, Heidrun Kerschner, Petra Apfalter, Rainer Hartl, Ariane Deplano, Stien Vandendriessche, Barbora Černá Bolfíková, Pavel Hulva, Maiken C. Arendrup, Rasmus K. Hare, Céline Barnadas, Marc Stegger, Raphael N. Sieber, Robert L. Skov, Andreas Petersen, Øystein Angen, Sophie L. Rasmussen, Carmen Espinosa-Gongora, Frank M. Aarestrup, Laura J. Lindholm, Suvi M. Nykäsenoja, Frederic Laurent, Karsten Becker, Birgit Walther, Corinna Kehrenberg, Christiane Cuny, Franziska Layer, Guido Werner, Wolfgang Witte, Ivonne Stamm, Paolo Moroni, Hannah J. Jørgensen, Hermínia de Lencastre, Emilia Cercenado, Fernando García-Garrote, Stefan Börjesson, Sara Hæggman, Vincent Perreten, Christopher J. Teale, Andrew S. Waller, Bruno Pichon, Martin D. Curran, Matthew J. Ellington, John J. Welch, Sharon J. Peacock, David J. Seilly, Fiona J. E. Morgan, Julian Parkhill, Nazreen F. Hadjirin, Jodi A. Lindsay, Matthew T. G. Holden, Giles F. Edwards, Geoffrey Foster, Gavin K. Paterson, Xavier Didelot, Mark A. Holmes, Ewan M. Harrison et Anders R. Larsen, 5 janvier 2022, Nature.
DOI: 10.1038/s41586-021-04265-w

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