En rouge, Bacteroides, un des micro-organismes identifiés dans ce travail, à l’intérieur du noyau d’une cellule pancréatique, en bleu. Crédit : CNIO
Une signature génétique de 27 microorganismes dans les selles définit la population à haut risque pour l’adénocarcinome du canal pancréatique, le cancer du pancréas le plus fréquent, et pourrait être utilisée pour la détection précoce de la maladie.
Le cancer du pancréas n’est pas l’un des cancers les plus fréquemment diagnostiqués, mais il est l’un des plus mortels en raison de son extension locale précoce et de son comportement métastatique. Ce taux de létalité élevé s’explique notamment par un diagnostic tardif de la maladie, d’autant plus que les symptômes sont peu spécifiques et apparaissent assez tard, et par des options thérapeutiques limitées.
À l’aide d’échantillons de patients fournis par un certain nombre de collaborateurs cliniques, des chercheurs du Centre national espagnol de recherche sur le cancer (CNIO), dirigé par Núria Malats, et du Laboratoire européen de biologie moléculaire (EMBL) de Heidelberg, dirigé par Peer Bork, ont découvert une signature moléculaire de 27 micro-organismes dans des échantillons de selles qui pourrait prédire si les patients présentent un risque élevé d’adénocarcinome du canal pancréatique, le cancer du pancréas le plus courant, et même diagnostiquer les patients à des stades plus précoces de la maladie.
Un brevet a été déposé pour développer un kit de diagnostic du cancer du pancréas qui détecte ces génomes microbiens dans les échantillons de selles de manière rapide, non invasive et abordable. L’étude a été publiée cette semaine dans la revue Gutl’une des revues les plus prestigieuses dans le domaine de la gastro-entérologie et de l’hépatologie.
Détection précoce du cancer du pancréas
Les symptômes du cancer du pancréas sont silencieux et apparaissent souvent à un stade avancé de la maladie, lorsque les tumeurs ne peuvent généralement pas être enlevées par chirurgie. Il existe donc un besoin urgent de tests non invasifs, spécifiques et abordables, capables de détecter la maladie à un stade précoce et d’améliorer la survie des patients.
“Dans de nombreux cas, une fois le cancer du pancréas détecté, il est trop tard. Nous devons diagnostiquer la maladie à un stade beaucoup plus précoce, avant l’apparition des symptômes. Pour ce faire, nous devons identifier et définir la population à risque et disposer de bons tests de dépistage pour détecter le cancer lorsqu’il est encore curable”, soulignent les chercheurs.
Núria Malats, chercheuse au CNIO. Crédit : Laura M. Lombardía. CNIO
Des données récentes suggèrent que les micro-organismes qui coexistent avec les cellules du corps humain – le microbiome – pourraient jouer un rôle dans l’origine et le développement de l’adénocarcinome du canal pancréatique.
Pour étudier en profondeur cette relation possible, les chercheurs ont mené une étude cas-témoins unique avec 136 individus (57 patients nouvellement diagnostiqués, 50 témoins et 27 patients atteints de pancréatite chronique) qui ont été profondément caractérisés aux niveaux épidémiologique et clinique et sur lesquels des échantillons de salive, de selles et de tissu pancréatique ont été prélevés pour analyser leur microbiome. Les sujets ont été recrutés dans deux hôpitaux espagnols à Madrid (Hôpital Ramon y Cajal) et à Barcelone (Hôpital Vall Hebron).
L’étude la plus complète du microbiome dans le cancer du pancréas.
Contrairement à la croyance commune, le microbiome oral ne s’est pas avéré être associé au cancer du pancréas, mais les microbes fécaux l’étaient. “Des analyses biostatistiques et bioinformatiques sophistiquées nous ont permis de construire une signature de 27 microbes dérivés des selles, principalement des bactéries, qui discrimine très bien les cas de cancer du pancréas et les témoins, à la fois dans leurs stades les plus avancés et les plus précoces”, ont déclaré Malats et Bork. Cette signature génétique a été validée dans une étude indépendante menée dans deux centres allemands, Francfort (hôpital universitaire Goethe) et Erlangen (clinique universitaire d’Erlangen), et dans 5 792 métagénomes fécaux provenant de 25 études réalisées dans 18 pays. Elle est actuellement étudiée dans une population japonaise.
Cependant, le cancer du pancréas est une maladie dont l’étiologie est très complexe et les facteurs de risque multiples tels que l’âge, l’obésité, le diabète, la pancréatite chronique, le tabagisme, la consommation élevée d’alcool, le groupe sanguin et les antécédents familiaux de cancer. Pour éviter les biais et s’assurer que les microbes identifiés sont associés au cancer du pancréas et non à l’obésité, au diabète ou à d’autres facteurs de risque, les auteurs ont contrôlé ces variables cliniques et démographiques dans l’analyse. “Ce niveau d’analyse est sans précédent dans les études sur le métagénome du cancer du pancréas”, ont déclaré les chercheurs.
Comme l’écrivent les chercheurs dans les pages de Gutla valeur prédictive élevée de cette signature génétique des selles pourrait servir de biomarqueur pour définir la population à risque et, si elle est validéedans les essais cliniques, il pourrait être utilisé pour le diagnostic précoce du cancer du pancréas. “Actuellement, les programmes de dépistage sont ciblés sur les familles présentant une agrégation de cancers du pancréas, qui ne représentent que 10% de la charge de la maladie. L’inclusion dans ces programmes de dépistage d’une analyse des selles pour identifier la signature microbienne identifiée pourrait aider à détecter le reste de la population à risque”, ont-ils ajouté.
Référence : “A Fecal Microbiota Signature with High Specificity for Pancreatic Cancer” par Kartal et al, 8 mars 2022, Gut.
DOI: 10.1136/gutjnl-2021-324755
Cette recherche a été réalisée en collaboration avec le groupe de carcinogenèse épithéliale du CNIO dirigé par Paco Real, l’unité de cytogénétique moléculaire du CNIO dirigée par Sandra Rodríguez, le service oncologique de l’hôpital universitaire Ramón y Cajal dirigé par Alfredo Carrato, le service des maladies digestives de l’hôpital universitaire Vall d’Hebron dirigé par Xavier Molero, la section d’hépatologie translationnelle de l’hôpital universitaire Goethe dirigée par Jonel Trebicka et le groupe de Stephan Kersting de la clinique universitaire d’Erlangen.
Cette étude a été financée par le World Cancer Research, le Conseil européen de la recherche, le Fonds européen de développement régional, le ministère espagnol des sciences et de l’innovation, l’Institut de la santé Carlos III, AESPANC-ACANPAN (bourse Carmen Delgado et Miguel Pérez-Mateo) et l’Union européenne (#018771-MOLDIAG-PACA, #259737-CANCERALIA).
