La protéine Spike à la surface du virus SARS-CoV-2 (marquée en rouge) reconnaît la protéine hACE2 (marquée en bleu) qui dépasse des cellules humaines saines de la gorge et des poumons. De cette façon, la protéine Spike agit comme une clé qui permet au virus d’envahir la cellule et d’utiliser sa machinerie pour se reproduire. L’aptamère d’ARN nouvellement développé (marqué en jaune) se lie très fortement à la protéine Spike et bloque sa capacité à reconnaître l’ACE2, empêchant ainsi une nouvelle infection. Crédit : Julián Valero, Université d’Aarhus
Une équipe de recherche à Université d’Aarhus a développé une nouvelle molécule qui se fixe à la surface de SRAS-CoV-2 particules virales. Cet attachement empêche le virus de pénétrer dans les cellules humaines et de propager l’infection.
La molécule nouvellement développée appartient à une classe de composés appelés ARN aptamères et il est basé sur le même type de blocs de construction qui sont utilisés pour les vaccins à ARNm. Cela les rend beaucoup moins chers et plus faciles à fabriquer que les anticorps qui sont actuellement utilisés pour traiter le Covid-19 et pour détecter les infections virales à l’aide de tests antigéniques rapides.
Un aptamère est un morceau de ADN ou ARN qui se replie dans une structure 3D qui peut reconnaître une molécule cible spécifique d’intérêt. En se fixant à la surface du virus, l’aptamère d’ARN empêche la protéine Spike de servir de clé permettant au virus d’entrer dans une cellule.
Par conséquent, l’aptamère à ARN n’est pas un nouveau type de vaccin mais un composé qui peut potentiellement empêcher le virus de se propager dans le corps une fois qu’une personne est exposée au virus.
La liaison efficace au virus SARS-CoV-2 signifie également que l’aptamère peut être utilisé pour tester l’infection par le covid-19.
“Nous avons commencé à tester le nouvel aptamère dans des tests rapides et nous espérons pouvoir détecter de très faibles concentrations du virus”, explique le professeur Jørgen Kjems de l’université d’Aarhus qui est l’auteur principal de l’article qui vient de paraître dans le prestigieux revue, PNAS.
Des études en culture cellulaire montrent que l’aptamère agit contre les variantes précédentes du coronavirus que les chercheurs ont eu l’occasion de tester.
« Depuis que nous avons soumis l’article à un examen par les pairs, nous avons poursuivi nos études et avons pu montrer qu’il reconnaît également la variante delta. Nous attendons maintenant des échantillons de la variante nouvellement identifiée, l’omicron, afin de pouvoir tester si l’aptamère le reconnaît également », explique Jørgen Kjems.
Il souligne que les résultats avec la variante delta n’ont pas encore été examinés par des pairs et publiés.
Référence : « Un aptamère à ARN stable dans le sérum spécifique au SARS-CoV-2 neutralise l’entrée virale » par Julián Valero, Laia Civit, Daniel M. Dupont, Denis Selnihhin, Line S. Reinert, Manja Idorn, Brett A. Israels, Aleksandra M Bednarz, Claus Bus, Benedikt Asbach, David Peterhoff, Finn S. Pedersen, Victoria Birkedal, Ralf Wagner, Søren R. Paludan et Jørgen Kjems, 7 décembre 2021, Actes de l’Académie nationale des sciences.
DOI : 10.1073/pnas.2112942118
Financement : Fondation Carlsberg, Fondation nationale danoise pour la recherche, Horizon 2020 de l’UE
