“Soupe variante” : Pourquoi la vague COVID de cet hiver pourrait être différente de toutes les phases pandémiques précédentes

Si l’on se fie aux deux derniers hivers, l’Amérique du Nord et l’Europe connaîtront probablement une vague d’infections par le COVID d’ici la fin de l’année, en raison du temps froid, de la promiscuité des élèves dans les salles de classe et des voyages pendant les vacances. Les responsables de la santé publique suivent de près la situation en surveillant les eaux usées, en séquençant la génétique du virus et en recherchant les cas positifs.

Mais un nombre croissant d’experts s’inquiètent du fait que cette vague pourrait être très différente des années précédentes. L’émergence de multiples variantes capables d’échapper à l’immunité pourrait survenir simultanément, ce qui n’a jamais été observé auparavant.

“Nous n’en avons jamais eu une comme ça avant. C’est différent.”

“Nous prévoyons une circulation continue du virus à l’origine du COVID-19 et la possibilité de poussées de la circulation du virus au cours des prochains mois”, a déclaré par courriel à Salon Jasmine Reed, porte-parole des Centres de contrôle et de prévention des maladies (CDC). Les CDC recommandent vivement à toute personne âgée de cinq ans et plus qui a droit à un rappel de vaccin actualisé de le faire. “Il est important de noter que nous savons que les vaccins COVID-19 mis à jour offrent une protection supplémentaire contre les variantes actuellement en circulation”, a ajouté M. Reed, faisant référence aux vaccins bivalents nouvellement disponibles qui, selon les études, protègent bien contre la variante BA.5 omicron.

La question reste de savoir quelle sera l’ampleur de la vague cette fois-ci, mais plusieurs facteurs – notamment le faible taux d’utilisation des rappels et la diminution du nombre de personnes portant des masques en public – pourraient compliquer la vague potentielle. Les données sur les infections par le COVID sont également quelque peu confuses car les tests positifs ne sont pas comptabilisés alors que le CDC et de nombreuses agences d’État ont commencé à mettre à jour leurs données chaque semaine au lieu de chaque jour.

Pour aggraver les choses, un groupe de variantes du COVID commence lentement à dominer simultanément – ce que de nombreux experts appellent une “soupe de variantes” – avec de nombreuses souches montrant une immunité surprenante à certains médicaments du COVID. Bien qu’il ait été démontré que les derniers vaccins fonctionnent toujours contre ces variantes, cela signifie que nous pourrions avoir un peu moins d’outils à notre disposition cet hiver. Reste à savoir si cela se traduira par des hôpitaux débordés, des perturbations de la chaîne d’approvisionnement ou une augmentation du nombre de décès.

“Nous n’en avons jamais connu de semblable auparavant. C’est différent”, a déclaré à Salon le Dr T. Ryan Gregory, biologiste de l’évolution et du génome à l’Université de Guelph au Canada. “Vous entendez nuage, essaim, grappe ou soupe de variantes. Toutes ces choses à la fois qui sont toutes immunisées.”

L’hiver dernier aux États-Unis, la variante omicron BA.1 a battu des records de cas quotidiens. Mais contrairement à la variante delta, elle n’a pas disparu au bout d’un certain temps ; au contraire, elle a continué à muter. Les sous-variantes ou enfants de l’omicron sont restés dans le coin, comme la BA.5, qui a été largement responsable d’infections, d’hospitalisations et de décès aux États-Unis pendant la majeure partie de l’année. Alors que les cas n’ont pas encore atteint le niveau record de janvier 2022, la pandémie s’est transformée en “un long plateau sans fin”, comme le dit The Atlantic.

Gryphon est une souche recombinante, ce qui signifie qu’elle possède le code génétique de deux sous-variantes omicron différentes. Elle a également été décrite par l’OMS comme “la variante la plus envahissante en termes d’anticorps à ce jour”.

Les nouvelles données montrent que la suprématie du BA.5 commence enfin à décliner. Malheureusement, cette fois, il pourrait être remplacé par plusieurs variantes à la fois.

“Je pense que nous sommes prêts pour un grand nombre de cas”, a déclaré Gregory. “Il reste à voir quelle sera leur gravité individuelle”.

Cette soupe de variantes comprend des virus comme XBB, BQ.1 et BF.7. Il est compréhensible que ces mélanges aléatoires de lettres puissent être assez déroutants pour en garder la trace. proposé une liste de surnoms pour certaines variantes basées sur des monstres de la mythologie grecque. Ainsi, BF.7 est le Minotaure et BQ.1 le Typhon, par exemple.

Ces variantes apparaissent de différentes manières à travers le monde. Au début du mois, la variante Gryphon (XBB) a commencé à augmenter fortement à Singapour, mais l’Organisation mondiale de la santé (OMS) l’a maintenant signalée dans 25 autres pays, selon Fortune. Gryphon est une souche recombinante, ce qui signifie qu’elle possède le code génétique de deux sous-variantes omicron différentes. Elle a également été décrite par l’OMS comme “la variante la plus envahissante en termes d’anticorps à ce jour”.

Heureusement, il existe d’autres outils contre le Gryphon, notamment le médicament Paxlovid, qui attaque le virus différemment des anticorps. L’humanité n’est donc pas complètement désarmée contre cette version du virus.

Pendant ce temps, New York connaît une forte augmentation des cas de Typhon (BQ.1) et de Cerberus (BQ.1.1), représentant 16,6 % des cas au total au 21 octobre, soit un bond de 5,1 %.pour cent il y a deux semaines. Ils semblent également capables d’échapper aux anticorps comme Evusheld et Bebtelovimab.

“BA.5 continue d’être responsable de la plupart des infections. BQ.1 et BQ.1.1 représentent un groupe restreint mais en croissance rapide de virus liés au BA.5 aux États-Unis”, a déclaré M. Reed, soulignant que les vaccins à ARNm de Pfizer et Moderna comprennent des composants qui ciblent des lignées antérieures du virus, de sorte qu’ils contribueront toujours à prévenir les hospitalisations et les décès.

Le CDC surveille de près toutes ces variantes, mais comme elles sont encore émergentes, les données à leur sujet sont limitées. Nous ne connaissons pas le degré d’immunité d’une variante contre une autre, de sorte que certaines personnes pourraient retomber malades immédiatement après une infection. Ou bien elles peuvent contracter plusieurs variantes à la fois.

“Je suis inquiet pour l’automne, qu’il y ait un pic, mais nous ne saurions même pas qu’il y a un pic.”

Jusqu’à présent, rien ne permet de penser que ces variantes provoquent une maladie plus grave. Mais comme toute personne ayant un long COVID vous le dira, cela n’a pas de sens de qualifier de “bénignes” ces ramifications de l’omicron.”

“Nous ne savons pas beaucoup de choses sur les variantes. Nous ne savons pas si l’une d’entre elles est plus grave que les autres.” a dit Gregory. “Attaquent-ils des tissus différents ? Est-ce que l’un d’entre eux est plus susceptible d’avoir un brouillard cérébral qu’un autre ou des problèmes cardiaques ? Nous n’en savons rien. C’est vraiment difficile à prévoir, beaucoup plus difficile à prévoir que de savoir si le virus va échapper à l’immunité. On peut regarder la structure de la protéine et faire une bonne estimation. Pour ce qui est de ce qu’elle va faire dans le corps, nous devons attendre et voir.”

La bonne nouvelle, c’est que les vaccins les plus récents semblent fonctionner contre toutes ces variantes, mais se fier uniquement aux vaccins est un manque de vision. Nous avons besoin de plus de tests et de surveillance du virus, ainsi que de plus de masques et d’une meilleure ventilation intérieure.

Le Dr Rajendram Rajnarayanan, vice-doyen de la recherche et professeur associé au campus de l’Institut de technologie de New York à Jonesboro (Arkansas), affirme que les tests antigéniques achetés en magasin devraient toujours être en mesure de détecter ces variantes, mais comme les résultats ne sont pas communiqués aux organismes de santé, les gens pourraient être laissés dans l’ignorance.

“Je suis inquiet pour l’automne, car il y aura un pic, mais nous ne saurons même pas qu’il y a un pic. C’est ce qui m’inquiète le plus”, a déclaré Rajnarayanan à Salon. Il a souligné que le public ne devait pas paniquer, mais rester informé et surveiller la situation afin de prendre des mesures pour se protéger mutuellement.

“L’absorption du booster est faible, le masquage est assez faible”, a déclaré Rajnarayanan. “Et que l’on soit libéral ou non, ce n’est vraiment plus une question de politique. Il s’agit plutôt de veiller les uns sur les autres. C’est ce genre de camaraderie que nous devons promouvoir.”

Même si cette soupe de variantes peut sembler effrayante, et que certains de nos outils contre elles ont été émoussés, nous avons encore beaucoup de ressources à notre disposition, notamment les masques et la distanciation sociale. La question est de savoir si nous les utiliserons à temps. Comme l’a récemment affirmé le Time Magazine, il ne semble pas que l’Amérique soit prête pour une vague d’hiver. Mais il est encore temps de rectifier le tir.

“Moins nous essayons d’empêcher les virus de se répliquer, plus nous allons voir de nouvelles variantes”, a déclaré Gregory. “La situation est différente à bien des égards. Il y a de multiples variantes, elles échappent toutes assez bien à l’immunité. Ils se développent simultanément, ce que nous n’avons jamais vu auparavant. Mais ma réaction à ce sujet est la même que pour le delta. Et la même qu’avec le premier omicron. Nous devons nous efforcer d’arrêter la transmission autant que possible.”

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