Pseudomonas aeruginosa, un organisme responsable de milliers de décès.
Des scientifiques de l’Université d’Australie du Sud ont fait une découverte surprenante sur les origines d’un gène résistant aux antibiotiques que l’on croyait jusqu’alors confiné à Adélaïde.
Le gène, détecté pour la première fois à Adélaïde en 2006, est porté par la méchante bactérie Pseudomonas aeruginosa, organisme responsable de milliers de décès chez les patients immunodéprimés, les chirurgiens et les grands brûlés en raison de sa résistance aux antibiotiques de dernier recours.
Ce gène rend les infections résistantes aux antibiotiques les plus puissants utilisés en médecine – l’imipenem et le meropenem. Résistance aux antibiotiques P. aeruginosa est désormais répertorié par l’Organisation mondiale de la santé comme un “pathogène prioritaire critique”, c’est-à-dire l’une des 12 familles de bactéries qui représentent la plus grande menace pour la santé humaine.
Jusqu’à présent, on pensait que le gène de l’imipénémase d’Adélaïde (AIM-1) n’était présent que dans la capitale de l’Australie du Sud après avoir été détecté dans des échantillons cliniques et des eaux usées liées aux soins de santé.
Mais un groupe de scientifiques dirigé par le professeur associé de microbiologie de l’UniSA, Rietie Venter, a démontré l’existence de ce gène dans le monde entier, en localisant sa source dans un organisme environnemental inoffensif présent dans le sol, les eaux souterraines, les eaux usées et même les plantes.
Les résultats ont été publiés dans le journal Microbial Genomics.
La découverte suggère que le gène s’est mobilisé à un moment donné et a sauté d’un organisme inoffensif à un méchant pathogène.
“Il s’agit d’un pathogène opportuniste, ubiquitaire et très résistant”, explique le professeur associé Venter.
L’équipe a utilisé des moyens innovants pour suivre et caractériser la résistance aux antimicrobiens, en faisant sa découverte par l’analyse des eaux usées. Leurs recherches ont révélé que le gène AIM-1 était présent sur de nombreux sites à Adélaïde et en Australie-Méridionale, y compris dans tous les échantillons d’eaux usées et dans l’eau des rivières, ce qui laisse supposer que le gène est plus répandu que prévu.
“Nous avons ensuite étudié la possibilité d’une distribution mondiale du gène AIM-1. Grâce à une recherche approfondie dans les bases de données de nucléotides et de protéines, nous avons découvert que le gène était également présent en Asie, en Amérique du Nord et en Europe.”
Cependant, l’AIM-1 a été trouvé principalement dans des organismes environnementaux inoffensifs et n’a fait le saut vers l’agent pathogène qu’au moment où il a été découvert. P. aeruginosa dans deux autres endroits jusqu’à présent (Iran et Irak).
Les gènes qui sont “mobiles” se déplacent tout le temps, mais le scénario décrit dans cette étude est beaucoup plus rare”, déclare le professeur associé Venter.
“Cependant, comme les microbes sont une grande source d’antibiotiques et qu’ils sont très compétitifs, il est très probable que de nombreux gènes de résistance bactérienne évoluent dans des organismes inconnus avant de se frayer un chemin vers des pathogènes dangereux, en particulier. P. aeruginosa, qui partage un habitat avec des organismes environnementaux inoffensifs. ”
Le professeur associé Venter dit que le gène AIM-1 doit être surveillé de près.
“Si nous pouvons mieux comprendre pourquoi les gènes sautent de l’environnement vers les pathogènes humains, nous pourrons peut-être empêcher que cela se produise plus souvent”, dit-elle.
Référence : ” Worldwide distribution and environmental origin of the Adelaide imipenemase (AIM-1), a potent carbapenemase in “. Pseudomonas aeruginosa” par Anteneh Amsalu, Sylvia A. Sapula, Jonathan J. Whittall, Bradley J. Hart, Jan M. Bell, John Turnidge et Henrietta Venter, 17 décembre 2021, Génomique microbienne.
DOI : 10.1099/mgen.0.000715
P. aeruginosa qui sont résistantes aux carbapénèmes – les meilleurs antibiotiques disponibles utilisés pour traiter les bactéries multirésistantes – constitue une menace particulière dans les hôpitaux, les maisons de retraite et chez les patients dont les soins nécessitent des appareils tels que des ventilateurs et des cathéters sanguins.
