Publié aujourd’hui dans la revue Open-Access, Open-Data GigaScience est la nationale COVID-19[feminine Chest Imaging Database (NCCID), une base de données centralisée contenant des radiographies pulmonaires, une tomodensitométrie (CT) et des IRM de patients à travers le Royaume-Uni. Bénéficiant de la position unique en tant que système de santé intégré le plus important au monde, les avantages de la collecte de données d’imagerie thoracique de cette taille sont considérables et déjà utilisés par les médecins et la communauté des chercheurs. La base de données soutient déjà le développement de logiciels de traitement d’images basés sur l’intelligence artificielle (IA) et de produits et modèles de diagnostic utilisés pour prédire la mortalité due au COVID-19 au Royaume-Uni. Et a également le potentiel de devenir une ressource à long terme pour l’enseignement des radiologues. Ces efforts offrent la possibilité de permettre une évaluation plus rapide des patients en cas d’accident et d’urgence, de faire gagner du temps aux cliniciens et d’augmenter la sécurité et la cohérence des soins à travers le Royaume-Uni.
Image pulmonaire anonymisée représentative de la base de données nationale d’imagerie thoracique COVID-19 (NCCID). Crédit : Collaboratif du CCNMI
Avec le GigaScience document décrivant comment accéder à cette ressource de données ouvertes, les données de formation du NCCID sont disponibles pour les utilisateurs partout dans le monde, y compris les développeurs de logiciels, les universitaires et les cliniciens, via un processus rigoureux de demande d’accès aux données. La base de données nationale d’imagerie thoracique Covid (NCCID) est l’un des plus grands ensembles de données de ce type et elle ne cesse de croître, avec 25 fiducies du NHS et plus de 25 fiducies du NHS et 27 hôpitaux contribuant. Collecte de données d’imagerie auprès de plus de 10 000 patients dans l’ensemble de formation NCCID pour mettre à disposition 34 559 études d’images et 1 663 Go de données.
Recueilli dans le but de favoriser une meilleure compréhension du virus COVID-19 et de développer une technologie qui permettra les meilleurs soins pour les patients hospitalisés pour une infection grave. Il s’agit d’une initiative établie par le NHSX, la nouvelle unité du gouvernement britannique chargée de définir la politique nationale et de développer les meilleures pratiques pour la technologie, le numérique et les données du National Health Service (NHS), y compris le partage et la transparence des données. Cela représente un effort national des radiologues et des équipes informatiques des sites du NHS, la British Society of Thoracic Imaging (BSTI), le Royal Surrey County Hospital (RSCH) et le NHS AI Lab ont collaboré à un moment où toutes les équipes avaient peu de capacité. pour des projets à long terme.
Interrogé sur l’utilité de ce travail, le premier auteur Dominic Cushnan a déclaré : « La base de données NCCID facilite la création d’outils de diagnostic basés sur l’IA qui peuvent augmenter et accélérer le diagnostic clinique de maladies (telles que COVID) et également soutenir études longitudinales sur l’effet de la maladie sur les patients et la gestion de la population »
Ces données ont déjà été utilisées par un certain nombre de projets et d’études, comme le LUCAS outil développé pour prédire le risque de mortalité des patients Covid à partir de variables patient (voir le préprint https://doi.org/10.1101/2021.04.27.21256196). Ainsi qu’un certain nombre de modèles et d’algorithmes alimentés par l’intelligence artificielle pour aider les médecins à décider des mesures à prendre en première ligne, telles que l’administration d’oxygène et de médicaments, avant que les patients n’atteignent un stade critique. Les Collaboration NHS AIX-COVNET de l’Université de Cambridge est l’un des premiers projets à utiliser ces données pour développer un outil d’IA open source pour soutenir le diagnostic rapide et le triage des patients atteints de COVID-19.
Les données pseudonymisées sont fournies via l’infrastructure cloud NHSE AWS après avoir rempli une demande d’accès aux données. Voir le site Web pour en savoir plus : https://nhsx.github.io/covid-chest-imaging-database
Référence : « Un aperçu de la base de données nationale d’imagerie thoracique COVID-19 : qualité des données et analyse de cohorte » 29 novembre 2021, GigaScience.
DOI : 10.1093/gigascience/giab076
