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UNE SRAS-CoV-2 une variante avec des traits similaires à ceux de la variante Delta – une transmissibilité améliorée et une capacité à infecter des personnes qui ont eu des infections/vaccinations antérieures – provoquera une pandémie plus grave avec plus d’infections et d’infections/réinfections percées que les variantes avec l’un ou l’autre trait seul, selon un modèle mathématique créé par des chercheurs de la Harvard TH Chan School of Public Health.
Leurs travaux, qui ont été publiés en ligne le 19 novembre 2021, dans la revue Cellule, pourrait aider les chercheurs et les responsables de la santé publique à interpréter l’importance des variantes nouvelles et existantes et à concevoir des réponses de santé publique sur mesure pour divers scénarios en fonction des caractéristiques d’une variante.
“Jusqu’à présent, les preuves d’une évasion immunitaire – la capacité d’une variante à échapper au système immunitaire et à provoquer des réinfections ou des infections révolutionnaires – ont été un signal d’alarme”, a déclaré Mary Bushman, co-auteur de l’article de Cell et chercheuse postdoctorale à le département d’épidémiologie de la Harvard Chan School. “Nos résultats indiquent qu’il s’agit peut-être davantage d’un drapeau jaune – ce n’est pas un gros problème en soi. Mais lorsqu’il est combiné à une transmissibilité améliorée, cela peut être un très gros problème. »
Au fur et à mesure que la pandémie de COVID progressait, des variantes du virus SARS-CoV-2 de type sauvage initial sont apparues. Certaines sont rapidement devenues une souche dominante et ont augmenté le nombre d’infections, comme les variantes Alpha et Delta, tandis que d’autres, comme Beta, n’ont pas réussi à s’installer ou à affecter de manière significative la trajectoire de la pandémie. Pour comprendre les effets que certains facteurs auraient sur une pandémie, Bushman a créé un modèle qui simule la façon dont les pandémies alimentées par des variantes hypothétiques affecteraient les populations qui utilisent diverses combinaisons de masquage avec distanciation physique et les vaccinations.
L’analyse a simulé une pandémie de SRAS-CoV-2 avec plusieurs variantes hypothétiques différentes, y compris des combinaisons des deux traits : une transmissibilité améliorée, similaire à la variante Alpha ; évasion immunitaire partielle, similaire à la variante bêta ; transmissibilité améliorée avec échappement immunitaire partiel, similaire à la variante Delta ; et une variante sans aucun trait. L’analyse a également pris en compte la manière dont certaines variables, telles que le masquage/la distanciation physique ou les vaccinations, affecteraient la trajectoire de la pandémie. Pour chacun des scénarios, les chercheurs ont analysé le nombre total d’infections ainsi que le nombre/pourcentage d’infections évitées grâce à la vaccination.
Bushman et leur équipe ont déterminé qu’une variante avec une transmissibilité améliorée serait probablement plus dangereuse qu’une variante qui pourrait partiellement échapper au système immunitaire. Pourtant, une variante avec les deux traits pourrait provoquer plus d’infections, de réinfections et d’infections révolutionnaires qu’une variante avec l’un ou l’autre des traits seuls.
Selon le modèle, la vaccination devrait également être très bénéfique dans le cas des variantes de type Delta, car les vaccinations empêcheraient un plus grand nombre de cas qu’un virus plus transmissible pourrait potentiellement causer, et parce que la nature plus douce des infections percées devrait réduire considérablement mortalité globale.
“Il est vraiment important que les gens réalisent que l’émergence de variantes comme Delta rend les niveaux élevés de vaccination d’autant plus cruciaux”, a déclaré Bill Hanage, professeur agrégé d’épidémiologie et co-auteur de l’article de Cell. “Même si nous ne pouvons pas éliminer le virus, nous pouvons garantir que les gens y font face avec la meilleure préparation, et un virus plus transmissible signifie qu’il y aura plus d’infections en l’absence de vaccination, donc plus de personnes pourraient en bénéficier.”
Parmi les autres co-auteurs de l’étude à la Harvard Chan School figuraient Rebecca Kahn, Bradford Taylor et Marc Lipsitch.
Cette recherche a été financée par le National Institute of Allergy and Infectious Diseases of the National Institutes of Health (R01AI128344), le US National Cancer Institute SeroNet (U01CA261277) et les Centers for Disease Control and Prevention des États-Unis (200-2016-91779).
Référence : « Impact sur la population des variantes du SARS-CoV-2 avec une transmissibilité améliorée et/ou une évasion immunitaire partielle » par Mary Bushman, Rebecca Kahn, Bradford P. Taylor, Marc Lipsitch et William P. Hanage, 19 novembre 2021, Cellule.
DOI : 10.1016/j.cell.2021.11.026