La science en toute simplicité : Qu’est-ce que la biologie des systèmes ?


Illustration du microbiome intestinal humain

La biologie systémique étudie l’interaction entre différents organismes vivants à plusieurs échelles.

Les microbes, les plantes, les animaux et les écosystèmes entiers jouent tous un rôle individuel dans le monde naturel, qui est un système complexe d’éléments interdépendants. Biologie systémique aborde l’étude des organismes vivants de manière holistique. Elle étudie comment les différents organismes vivants interagissent à différentes échelles. Chaque être humain, par exemple, est un système. Nos organes, nos tissus, nos cellules et les molécules dont ils sont constitués, ainsi que les bactéries et autres organismes qui vivent sur notre peau et dans notre système digestif, font tous partie du système.

La biologie systémique étudie ces éléments et la façon dont ils fonctionnent ensemble. Les scientifiques peuvent adapter l’approche de la biologie systémique en fonction de la taille du système qu’ils étudient. Par exemple, les organes humains peuvent agir comme leurs propres systèmes, composés de cellules, de protéines et de

Les acides aminés sont un ensemble de composés organiques utilisés pour construire des protéines. Il existe environ 500 acides aminés connus à l’état naturel, mais seuls 20 apparaissent dans le code génétique. Les protéines sont constituées d’une ou plusieurs chaînes d’acides aminés appelées polypeptides. La séquence de la chaîne d’acides aminés permet au polypeptide de se plier en une forme biologiquement active. Les séquences d’acides aminés des protéines sont codées dans les gènes. Neuf acides aminés protéinogènes sont dits “essentiels&quot ; pour les humains car ils ne peuvent pas être produits à partir d’autres composés par le corps humain et doivent donc être absorbés sous forme de nourriture.

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Systems biology relies on computational and mathematical analysis and modeling. It draws its data from a huge range of biological sciences and technologies that researchers often call “-omics.” Some of these “omics” include genomics (the study of complete sets of genes in an organism) and proteomics (the study of all the proteins in a cell, tissue, or organism). These disciplines share an emphasis on characterizing and quantifying the biological molecules behind how organisms are built, function, and live.

Systems biology has many potential applications. One major application is bioenergy research. Scientists are working to understand plants that could be used for biofuel, including how they grow, the microbes that break them down, and how these components work together. This approach helps scientists improve the system behind biofuels to make more efficient, cost effective, and renewable fuels. Systems biology is also critical to understanding the cycling of carbon. Much of the world’s carbon dioxide is stored in ecosystems such as forests and tundra. Scientists are studying the complex interactions between the soils and plants that capture carbon dioxide as well as the microbes that break down organic material and release its carbon as carbon dioxide back into the atmosphere.

Fast Facts

  • Systems biology studies of the genomes of soil-dwelling microbes discovered that they are also infected by thousands of different viruses that affect how they modify carbon-rich organic material.
  • Comparing the decoded genomes of different plants helps us understand how plants sequester carbon dioxide and store carbon in cellulose and other polymers that constitute the plant body.
  • Baker’s yeasts are used to make ethanol not only for beer but also as a biofuel. Understanding their systems biology allows scientists to engineer new yeast strains that can one day produce a replacement for gasoline.

Department of Energy Office of Science Contributions to Systems Biology

The Department of Energy Office of Science, Biological and Environmental Research (BER) program funds a broad range of research that rests on a systems biology perspective. One major effort is DOE’s Genomic Science program, which applies systems biology to problems involving energy and the environment.

Starting with the genetic information encoded in organisms’ genomes, BER research seeks to discover the principles that guide the translation of the genetic code. Researchers also study the metabolic and regulatory networks underlying the physiology of plants and microbes as they respond to and modify their environments. This understanding will help researchers design microbes and plants that contribute to energy independence and clean energy. For example, systems biology could lead to better biofuels and bioproducts, improved carbon storage, and new control over nutrients and contaminants in the environment.

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