Comme neuf SRAS-CoV-2 L’Institut de Virologie et d’Immunologie (IVI) et l’Université de Berne, avec des collaborateurs internationaux, ont étudié les variantes émergentes chez l’animal.in vivo), en interaction biophysique et en culture cellulaire (in vitro). L’originalité de cette nouvelle étude est d’avoir mis les variants en compétition directe dans de multiples modèles pour révéler pourquoi certains variants avaient un réel avantage pour se répandre mondialement.
Selon Charaf Benarafa, auteur principal de l’étude : “Pris indépendamment, chacun des variants semble être aussi efficace que son progéniteur, le virus initial : il est difficile de les séparer. En recréant les conditions naturelles de compétition, où un variant émergent et son progéniteur sont simultanément présents, il devient possible de détecter réellement quel variant va préférentiellement se propager et être transmis à un autre individu. Le défi de notre étude était d’associer différents modèles expérimentaux pour mieux comprendre ces mécanismes ; et les analyses combinées nous ont permis de discriminer les différences entre les variants.”
Alpha gagne dans les modèles restrictifs, tandis que bêta est le “grand perdant”.
La compétition entre les variantes alpha et bêta et leur progéniteur montre clairement que la variante alpha a un avantage. Charaf Benarafa explique : “Les modèles les plus restrictifs de la compétition virale nous ont montré que le variant alpha domine et se propage mieux dans les voies respiratoires supérieures et se transmet plus efficacement. Tous les modèles ont également montré que la variante bêta est la “grande perdante”. Il semble que le variant bêta ait bénéficié de circonstances épidémiologiques favorables pour se développer localement. En revanche, le variant alpha, qui s’est répandu à l’échelle mondiale, a démontré son potentiel de transmission élevé intrinsèque par ses mutations de pointe.
Pendant ce temps, d’autres variants émergent
Prédire quelle variante se répandra le mieux et pourquoi reste un défi. Seules des études approfondies peuvent permettre de mieux comprendre les facteurs associés à cette propagation. Selon Charaf Benarafa, “c’est avec une combinaison de différents facteurs que le virus se propage. in vitro et in vivo que nous avons pu consolider nos résultats pour expliquer la dominance du variant alpha dans les populations immunologiquement naïves. Maintenant qu’une proportion importante de la population est vaccinée, nous devrons également considérer l’impact de l’immunité sur l’avantage des nouveaux mutants émergents.”
Référence : “Enhanced fitness of SARS-CoV-2 variant of concern Alpha but not Beta” par Lorenz Ulrich, Nico Joel Halwe, Adriano Taddeo, Nadine Ebert, Jacob Schön, Christelle Devisme, Bettina Salome Trüeb, Bernd Hoffmann, Manon Wider, Xiaoyu Fan, Meriem Bekliz, Manel Essaidi-Laziosi, Marie Luisa Schmidt, Daniela Niemeyer, Victor Max Corman, Anna Kraft, Aurélie Godel, Laura Laloli, Jenna N. Kelly, Brenda M. Calderon, Angele Breithaupt, Claudia Wylezich, Inês Berenguer Veiga, Mitra Gultom, Sarah Osman, Bin Zhou, Kenneth Adea, Benjamin Meyer, Christiane Eberhardt, Lisa Thomann, Monika Gsell, Fabien Labroussaa, Jörg Jores, Artur Summerfield, Christian Drosten, Isabella Anne Eckerle, David E. Wentworth, Ronald Dijkman, Donata Hoffmann, Volker Thiel, Martin Beer et Charaf Benarafa, 22 décembre 2021, Nature.
DOI: 10.1038/s41586-021-04342-0
