Les différences génétiques désavantagent les cellules immunitaires. Crédit : Institut d’immunologie de La Jolla
Une nouvelle recherche LJI montre comment une gamme de cellules immunitaires critiques répondent à SRAS-CoV-2.
De nouvelles recherches montrent comment les variations génétiques liées aux cas graves de COVID-19[feminine affecter nos cellules immunitaires.
L’étude, dirigée par des scientifiques de l’Institut d’immunologie de La Jolla (LJI), est l’une des premières études approfondies sur les liens entre la gravité du COVID-19 et l’expression des gènes dans de nombreux types de cellules immunitaires. Ce travail pourrait guider le développement de nouvelles thérapies COVID-19 pour stimuler la fonction des cellules immunitaires.
Parmi leurs découvertes, les chercheurs rapportent qu’un gène d’un type cellulaire appelé monocytes non classiques, qui fait partie de l’équipe de « premiers intervenants » de cellules immunitaires innées du corps, pourrait être une cible potentielle pour les thérapies COVID-19.
“Cette étude met en évidence le pouvoir de la génétique humaine pour découvrir de nouvelles voies liées à la maladie”, déclare le professeur LJI Pandurangan Vijayanand, MD, Ph.D., auteur principal du Communication Nature étudier.
La communauté scientifique a identifié de nombreuses différences génétiques, appelées polymorphismes, qu’ils appellent “variantes à risque COVID-19 sévères”. Ces variantes génétiques sont associées à l’expression des gènes et semblent influencer la gravité des cas. Pourtant, les scientifiques ne savaient pas quelles cellules immunitaires sont les plus touchées par ces variantes de risque.
Pour la nouvelle étude, Vijayanand et ses collègues ont combiné les données génétiques des patients de la COVID-19 Host Genetic Initiative et de la base de données en accès libre des épigénomes des cellules immunitaires (DICE) de LJI pour définir les gènes et les types de cellules sensibles affectés par ces variantes de risque. L’équipe a examiné 13 sous-types des principales cellules protectrices et anti-virus du corps : les cellules T, les cellules B, les cellules NK et les monocytes.
“Il existe de nombreux types de cellules immunitaires différents, et ils contribuent tous à de petites fonctions à l’image globale”, explique le premier auteur de l’étude Benjamin Schmiedel, Ph.D., instructeur au LJI. « Nous devons examiner chaque type de cellule immunitaire séparément pour déterminer comment le système immunitaire est capable de répondre à COVID. »
Les chercheurs ont identifié plusieurs associations importantes de variantes génétiques avec des gènes. Parmi eux se trouvait une variante de risque qui affectait 12 des 13 types cellulaires étudiés. Cette variante sévère à risque de COVID-19 dans le chromosome 21 était associée à une expression réduite d’un récepteur sur les cellules appelées IFNAR2. Ce récepteur fait partie d’une voie de signalisation qui alerte le système immunitaire en cas d’infection. Cette nouvelle association peut aider à expliquer pourquoi certaines personnes ne parviennent pas à développer une forte réponse immunitaire au SRAS-CoV-2.
Pendant ce temps, une variante à risque sur le chromosome 12 a montré l’effet le plus fort dans les monocytes non classiques, un type de cellule immunitaire innée qui patrouille dans le corps et envoie des molécules de signalisation pour alerter les autres cellules immunitaires des menaces. La variante à risque a conduit les monocytes non classiques à réduire l’expression d’un gène appelé OAS1. Un manque de OAS1 l’expression pourrait entraver les défenses de l’organisme en réduisant l’expression d’une famille de protéines qui dégrade normalement les virus ARN et active les réponses antivirales du système immunitaire.
“Les monocytes non classiques sont un type de cellule rare et peu étudié”, explique Schmiedel. “Ils ne représentent qu’environ deux pour cent des cellules immunitaires.”
Schmiedel espère mener d’autres évaluations précliniques pour déterminer le rôle de ces gènes dans la pathogenèse du COVID-19. “Le fait que nous puissions identifier ces types de mécanismes génétiques est un grand pas en avant”, dit-il. “Nous pouvons utiliser les informations disponibles, les combiner avec nos données sur les cellules immunitaires et trouver des cibles potentielles pour le traitement.”
Référence : « Les variantes génétiques du risque COVID-19 sont associées à l’expression de plusieurs gènes dans divers types de cellules immunitaires » 19 novembre 2021, Communication Nature.
DOI : 10.1038/s41467-021-26888-3
D’autres auteurs de l’étude, « les variantes génétiques du risque COVID-19 sont associées à l’expression de plusieurs gènes dans divers types de cellules immunitaires », incluent Job Rocha, Cristian Gonzalez-Colin, Sourya Bhattacharyya, Ariel Madrigal, Christian H. Ottensmeier, Ferhat Ay et Vivek Chandra.
L’étude a été soutenue par le National Institute of Health (subventions R24-AI108564, R35-GM128938, S10RR027366, S10OD016262 et S10OD025052) et la Fondation William K. Bowes Jr..
